Also ich würde es mal mit GeneralUtility::makeInstance versuchen. So in etwa: (Ungetestet)
use TYPO3\CMS\Core\Utility\GeneralUtility;
use In2code\Femanager\Domain\Model\User;
use In2code\Femanager\Controller\NewController;
$user = GeneralUtility::makeInstance(User::class);
// ... Benutzerdaten hinzufügen
$newController = GeneralUtility::makeInstance(NewController::class);
$newController->createAction($user);
Allerdings wirst Du den NewController nicht einfach so instanziieren können. Schau Dir mal den Konstruktor des AbstractController an. Die Klassen die dort als Parameter stehen wirst Du mit übergeben müssen, wenn Du den NewController instanziierst.