Ich denke nicht, dass dieser Fehler direkt mit Deinem ursprünglichen Problem zusammenhängt.
Laut dem Fehler kann eine Typoscript Condition nicht geparsed werden. Entweder ist es ein Bug in der EXT:bootstrap_package oder Du verwendest die Abfrage in einem eigenen Typoscript an einer Stelle wo diese Funktion nicht verfügbar ist. Der Fehler selbst sollte aber nicht der Grund sein, warum Du nicht ins Backend kommst und einen 503 bekommst.
Das große Problem an dem Fehler ist, dass dieser bei jedem Seitenaufruf auftritt und Dir höchstwahrscheinlich das Log vollgeschrieben hat.
Schau mal wie groß die Log-Datei ist. Durch solche Fehler kann die Datei über einen längeren Zeitraum schon mal sehr groß werden.
Wenn die Datei sehr groß ist, kannst Du die einfach löschen. Die wird dann neu erzeugt.